Estos son los registros de libros publicados por Juan Carlos Villa Soto.
| ISBN | Título | Editorial | Autor(es) | Año |
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| 978-607-02-5759-9 | Totalidades y complejidades: crítica a la ciencia reduccionista | Universidad Nacional Autónoma de México | Germinal Cocho Gil Juan Carlos Villa Soto Julio Muñoz Rubio Victor Flores Olea | 2014 |
| 978-607-02-6039-1 | Totalidades y complejidades: crítica a la ciencia reduccionista | Universidad Nacional Autónoma de México | Amparo Martínez Arroyo Andrés Barreda Marín Germinal Cocho Gil John Saxe Fernández José Luis Gutiérrez Sánchez Juan Carlos Villa Soto Julio Muñoz Rubio Marco Antonio Martínez Negrete Pedro Miramontes Vidal Victor Flores Olea | 2014 |
| 978-607-9293-16-1 | Los saberes locales, educación y organización | Asociación Mexicana de Estudios Rurales | Amada Rubio Herrera Edmundo Arturo Pérez Godínez Imelda Aguirre Mendoza José Manuel Juárez Núñez Juan Carlos Villa Soto María Teresa Castillo Burguete Rosaura Reyes Canchola Sonia Comboni Salinas | 2015 |