| 978-958-9129-17-3 | Biota y ecosistema de Gorgona | Fondo Fen Colombia | Jaime Aguirre Ceballos Orlando Rangel Ch. | 1990 |
| 978-958-701-241-5 | Hongos Liquenizados | Universidad Nacional de Colombia | Jaime Aguirre Ceballos Martha Chaparrro de Valencia | 2002 |
| 978-958-719-051-9 | Santa María Líquenes, Hepáticas y Musgos | Universidad Nacional de Colombia | Jaime Uribe Meléndez Jaime Aguirre Ceballos Laura Victoria Campos Salazar | 2008 |
| 978-958-761-087-1 | Retratos para un aniversario: Evocando la historia. Instituto de Ciencias Naturales 75 años | Universidad Nacional de Colombia | Jaime Aguirre Ceballos Germán Amat García Jaime Aguirre Ceballos Jaime Uribe Meléndez | 2011 |
| 978-958-761-434-3 | Uso del buchón de agua (Eichhornia crassipes), en actividades de recuperación y restauración de àreas intervenidas en proyectos hidroeléctricos. | Universidad Nacional de Colombia | Gladys Cárdenas Arévalo Hernán Sánchez Cruz Jaime Aguirre Ceballos Juan Herrera Romero Mauricio Aguilar Puentes | 2013 |
| 978-958-775-476-6 | Protagonistas de la biodiversidad en Colombia | Universidad Nacional de Colombia | Germán Domingo Amat García Jaime Uribe Meléndez Jaime Aguirre Ceballos Martha Patricia Hernández Moreno Paola Marcela Triviño Cruz Sergio Ospina Rey | 2015 |
| 978-958-775-477-3 | Protagonistas de la biodiversidad en Colombia | Universidad Nacional de Colombia | Germán Domingo Amat García Jaime Uribe Meléndez Jaime Aguirre Ceballos Martha Patricia Hernández Moreno Paola Marcela Triviño Cruz Sergio Ospina Rey | 2015 |
| 978-958-775-856-6 | Áreas propuestas para las actividades de reubicación de la fauna silvestre que será afectada por las actividades constructivas y de adecuación del vaso del embalse del proyecto hidroeléctrico Ituango | Universidad Nacional de Colombia | Adriana Prieto Cruz Agustín Rudas Lleras Camilo Loaiza Gómez Darwin Manuel Morales Martínez Elkin Luis Rodríguez Ortíz Hernán Alonso Serrano Jaime Aguirre Ceballos José Gregorio Viloria Rivas Juan Camilo Bonilla González Juan Carlos Arias García Juliana Rodríguez Ortiz Luisa F. Liévano Latorre Mateo Jaimes Roncancio Nicolás Alfonso Amaya Rabe Olga Lucía Montenegro Raúl Esteban Quiñones Betancourt Sandy Bibiana Arroyo Sánchez Vladimir Andrés Bernal González | 2016 |
| 978-958-775-857-3 | Áreas propuestas para las actividades de reubicación de la fauna silvestre que será afectada por las actividades constructivas y de adecuación del vaso del embalse del proyecto hidroeléctrico Ituango | Universidad Nacional de Colombia | Adriana Prieto Cruz Agustín Rudas Lleras Camilo Loaiza Gómez Darwin Manuel Morales Martínez Elkin Luis Rodríguez Ortíz Hernán Alonso Serrano Jaime Aguirre Ceballos José Gregorio Viloria Rivas Juan Camilo Bonilla González Juan Carlos Arias García Juliana Rodríguez Ortiz Luisa F. Liévano Latorre Mateo Jaimes Roncancio Nicolás Alfonso Amaya Rabe Olga Lucía Montenegro Raúl Esteban Quiñones Betancourt Sandy Bibiana Arroyo Sánchez Vladimir Andrés Bernal González | 2016 |