Estos son los registros de libros publicados por Juan Manuel Pat Fernández.
| ISBN | Título | Editorial | Autor(es) | Año |
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| 978-607-7637-54-7 | Surgimiento y legalización de la cooperativa "Loól Xaàn" en la reserva Los Petenes, Campeche, México | El Colegio de la Frontera Sur | Antonio López Meza Juan Manuel Pat Fernández Pablo Hernández Bahena | 2012 |
| 978-607-7637-59-2 | Caracterización y usos del maíz criollo en Los Petenes, Campeche, México | El Colegio de la Frontera Sur | Carlos Tucuch Cahuich Juan Manuel Pat Fernández Pablo Hernández Bahena | 2012 |
| 978-607-402-644-3 | Introducción a los modelos de regresión | Plaza y Valdes | Aarón Horacio Martínez Menchaca Juan Manuel Pat Fernández Lucio Pat Fernández | 2013 |