Estos son los registros de libros publicados por Juan Jacobo Agudelo Galeano.
| ISBN | Título | Editorial | Autor(es) | Año |
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| 978-958-99472-1-0 | Memorias Segundo Simposio de la Investigación Técnica, Profesional y Tecnológica | Asociación Colombiana de Instituciones de Educación Superior con Formación Técnica Profesional y/o T | Juan Jacobo Agudelo Galeano Margarita María Osorno Mejía Juan Clímaco Botero | 2012 |
| 978-958-59647-1-6 | Elementos para una genealogía del paramilitarismo en Medellín: historia y contexto de la ruptura y continuidad del fenómeno (II) | Grupo de Investigacion y Editorial Kavilando | Alfonso Insuasty Rodríguez Jose Fernando Valencia Grajales Juan Jacobo Agudelo Galeano | 2016 |
| 978-958-59647-2-3 | Elementos para una genealogía del paramilitarismo en Medellín: historia y contexto de la ruptura y continuidad del fenómeno (II) | Grupo de Investigacion y Editorial Kavilando | Alfonso Insuasty Rodríguez Jose Fernando Valencia Grajales Juan Jacobo Agudelo Galeano | 2016 |